Sebagaimana Tugas Pokok dan Fungsi BPK sebagai Badan Pemeriksa seluruh Instansi Kementerian dan Lembaga, bahwa BPK akan mengadakan pemeriksaan di seluruh Indonesia. Adapun pada Kementerian Agama bahwa BPK akan melaksanakan audit di berbagai propinsi, baik di Kanwil, Perguruan Tinggi Islam maupun Kankemenag di daerah. Jombnag masuk sebagaim salah satu sampling pemeriksaan BPK yang dijadwwalkan antara tanggal 1 sampai dengan 13 Pebruari 2021.

Lebih jauh sesungguhnya pemeriksaan ini terkait perencanaan, pelaksanaan dan pertanggung jawaban penggunaan APBN selama tahun anggaran 2020. BPK terdiri dari beberapa tim yang selanjutnya  memeriksa awal pada kiriman data yang diemail ke email BPK.